Jakościowa i ilościowa detekcja mikroorganizmów (bakterie, grzyby, archeony i wirusy) z zastosowaniem metod PCR oraz real-time PCR
Opracowanie nowoczesnych metod diagnostyki mikrobiologicznej z zastosowaniem: fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ; spektroskopii ramanowskiej; uczenia maszynowego (ang. machine learning); testów ELISA; szybkich testów immunochromatograficznych
Identyfikacja drożdży i grzybów strzępkowych
Typowanie PFGE różnych gatunków bakterii dla celów epidemiologicznych
Typowanie molekularne mikroorganizmów przy użyciu metod PFGE, MLVA, MLST , sekwencjonowania
Badanie lekooporności szczepów z rodzaju Acinetobacter spp. na oddziałach szpitalnych wraz z analizą molekularną
Detekcja genów determinujących wirulencję i lekooporność szczepów izolowanych z zakażeń z zastosowaniem metod PCR oraz real-time PCR
Nadzór nad lekoopornością drobnoustrojów w praktyce klinicznej
Badanie lekowrażliwości grzybów
Zarządzanie lekiem przeciwdrobnoustrojowym i nadzór nad lekoopornością drobnoustrojów
Aktywność iminocukrów wobec typowych bakterii tworzących biofilm izolowanych od zakażonych pacjentów
Przeciwzapalne i antynowotworowe działanie witmainy K2-MK7 w oparciu o mysi model raka jelita grubego
Ocena właściwości przeciwbakteryjnych i przeciwwirusowych wybranych substancji i materiałów z zastosowaniem hodowli komórkowych, metod mikroskopowych i spektrofluorymetrycznych
Badanie aktywności przeciwgrzybiczej i przeciwbakteryjnej różnych substancji
Zakażenia przenoszone drogą kontaktów seksualnych
Epidemiologia grzybic inwazyjnych
Dermatofitozy i niedermatofitowe czynniki etiologiczne zakażeń skóry i jej przydatków
Profilaktyka i kontrola zakażeń w leczeniu szpitalnym i ambulatoryjnym
Nadzór nad zakażeniami w opiece długoterminowej
Clostridioides difficile w kontroli zakażeń
Flora fizjologiczna dróg rodnych
Zaburzenia składu i funkcji mikrobiomu jelit w przebiegu różnych chorób przewodu pokarmowego
Rola Toxoplasma gondii w rozwoju schizofrenii
Badania metagenomiczne – ocena składu jakościowego mikrobioty z materiałów biologicznych w przebiegu różnych chorób (celiakia, choroba Leśniowskiego-Crohna, cukrzyca typu 1 i 2, otyłość, sepsa, COVID-19, schizofrenia, infekcyjne zapalenie wsierdzia, miażdżyca, endometrioza, niepłodność) z zastosowaniem sekwencjonowania nowej generacji
Zastosowanie probiotyków w schorzeniach dróg rodnych i przewodu pokarmowego
Czynniki wirulencji bakterii Gram-dodatnich
Badanie immunogennych białek wybranych bakterii patogennych oraz ocena immunoreaktywności epitopów rdzennych vs. epitopów modyfikowanych poprzez skracanie lub podstawianie, przy zastosowaniu metod: SDS-PAGE; immunoblotting; Pepscan; ELISA
Badanie zmian fenotypowych, genotypowych i epigenetycznych wybranych gatunków bakterii, herpeswirusów oraz HPV o wysokim potencjale onkogennym
Biofilmotwórczość i analiza mikrobiologiczna szczepów z rodzaju Acinetobaceter spp. izolowanych z różnych typów zakażeń od pacjentów hospitalizowanych
Ocena zdolności tworzenia biofilmu oraz jego dynamiki (biofilm w przepływie) przez kliniczne szczepy bakterii przy zastosowaniu metod jakościowych i ilościowych (ocena stopnia zajęcia powierzchni; hodowla; ilościowy real-time PCR), oraz metod obrazowania (mikroskopia fluorescencyjna; SEM)
Opracowywanie nowoczesnych metod zwalczania biofilmu bakteryjnego z wykorzystaniem: nanocząstek metali szlachetnych; nanocząstek antybiotyków; białek o właściwościach przeciwbakteryjnych; a także poprzez funkcjonalizowanie powierzchni na drodze wbudowania różnych grup funkcyjnych ZMMM
Ocena zdolności tworzenia przez drobnoustroje biofilmów na powierzchniach abiotycznych
